斯人已逝，余香袅袅-------纪念神经生物学的侠之大者 Seymour Benzer
斯人已逝，余香袅袅-------纪念神经生物学的侠之大者 Seymour Benzer
今天11月30号，俺个衰人有无数的construct要做，有两个deadline要赶，还有TA的课要出卷子。。。
但是今天我还是要写写日志，写写我非常敬佩的一个生物学家，今天是他的纪念日
Seymour Benzer （1921-2007.11.30）
从某种意义上讲benzer是Watson，Crick，Jacob，Monod，德尔吕布克那一辈开创生物分子生物学的黄金一代硕果仅存的几位：Crick逝世，Watson基本在忽悠，俺们线虫的老祖宗Brenner现在基本已经没有人懂他在说什么。。。。
他的逝世代表了一个时代开始终结，不知道是不是另一个时代的开始？。。。。
他没有能得到Nobel奖，但是他在半导体物理，分子生物学，神经生物学都有巨大贡献，是当之无愧的无冕之王，侠之大者。
在他逝世后，他的学生在Nature，Science，Neuron，Plos Bio，Genetics，Cur Bio上发表文章悼念他
他在逝世之后的三年，还有Cell，Neuron，Cur Bio，PNAS陆续发表，虽然通讯作者已经是他的学生或者同事，斯人已逝，余香袅袅。
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最早知道Benzer还是在本科学生化和遗传的时候，教科书上提到过的利用噬菌体（phage）遗传学解决了基因的精细结构问题，虽然当年北大王镜言版的生化就从来没有把这个问题讲清楚过，当然当年乔爷也只是泛泛的提到而已。。。。。。没想到到了美国学遗传课，才有机会重新读了读他那篇里程碑的1955年的 PNAS，更没想到哥么ribonsome在jhu选了门Jeremy Nathan开得的文献选读课，第一篇就是这篇pnas，这是后话 暂且不表。
后来在科学院上bio2000，听了ucla 大美女Ming Guo的讲座才知道她的phd老板，大名鼎鼎的詹裕农，叶公杼夫妇的导师是Benzer，她的postdoc老板 Larry Zipursky的导师也是Benzer，她讲Benzer他老人家80岁高龄还在实验室数果蝇，她还推荐了一本关于Benzer的传记
Time, Love, Memory: A Great Biologist and His Quest for the Origins of Behavior
作者是普利策奖得主
再后来，听了詹裕农，叶公杼夫妇的一堆弟子的talk，Morgan Shen，骆利群，利民，钟为民，对Jan夫妇敬佩的同时时不时会想想他们的老板 Benzer；后来和ribonsome闲聊的日子里，听他讲DSCaM，听他讲去Larry Zipursky实验室的见闻，对Larry同学惊为天人。。。。
再后来，到了美国，因为要去果蝇（fruit fly）实验室做rotation，在恶补果蝇知识的时候读了本 fly push，它的作者Greenspan也是Benzer的博后；后来在一位出身caltech Sternberg 实验室，Larry的postdoc，灰常聪明的老师手下做第三轮rotation，Benzer是他的phd thesis committee，听他聊benzer的趣事。据说这哥么仅靠一篇半neuron横扫北美tier 1学校的offer，相当大的一部分原因是他有Benzer的推荐信，当然他骇人听闻的smart也是重要原因。。。。。
再后来，告别果蝇，加入了现在的线虫实验室，实验室新来的博后师姐来自Upenn，她的导师 Nancy Bonini也是Benzer的博后，也是Benzer的粉丝。。。。后来干脆买了本Time, Love, Memory: A Great Biologist and His Quest for the Origins of Behavior，细细读来，真得是生物学的传奇啊！
就容小的来给各位看官侃侃吧
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Benzer，波兰裔犹太人，出生纽约，二战期间在当时工程物理大牛校 Purdue读phd，为曼哈顿计划服务，发展高功率雷达。因为当时受体积巨大，能耗惊人的电子管束缚，雷达始终面临瓶颈。Benzer的phd project就是发展可能的电子管替代半导体，他发明的锗掺杂技术，证明可以实现高压下整流效果，然后顺利毕业。。。。。如果故事到了这里就结束，那就不是传奇了。
他发明的这项技术专利一年后来被Bell实验室的仨人：巴丁，肖克莱，布拉克利用，发明了晶体管。。。。。Benzer后来还应邀参加了这三人的庆祝诺贝尔奖的party。。。。
靠着这本事，Benzer顺利在Purdue物理系拿到tenure track，结果他不误正业，在读了薛定谔的“生命是什么”（what is life？）之后被忽悠，开始搞biophysics，从purdue请假到处做postdoc，满世界的整整逛了4年，差点被purdue开了。 期间遇到phage的一代教父Max Delbruck （德尔吕布克，玻尔的学生）
，觉得这种细菌病毒不错，回到purdue开始转型做噬菌体。。。。。 他做了啥捏？
当时经典遗传学从孟德尔到摩尔根，从豌豆数到果蝇，基本确定基因是在染色体上线形排列的；根据Watson和Crick的DNA 双螺旋结构工作，遗传物质是核酸，是DNA。但是基因和核酸之间到底是什么关系，并不清楚。这个工作的主要构架就是Benzer完成的。他用筛到的数量巨大的T4 phage的rII（rapid lysis）突变体之间做杂交。根据经典遗传学互补测试（complementation test）概念，同一个基因的两个突变体（allelles）杂交，得到的还是突变体。但是在Benzer的系统中，因为样本巨大（一个大肠杆菌可以产出上千个phage）他发现可以得到少量的正常phage，可以正常侵染大肠杆菌。他推测这是源于两个突变DNA重组后得到正常个体的结果。这表明基因不是最小的遗传分子单位，揭示了基因可以有更精细的结构。。。。。。结果发表在当年的nx杂志PNAS上，成为分子生物学的里程碑之一。
后来他的rII被Crick和Brenner利用，利用rII在核酸水平上的精度证明了三联密码子假说，当然这又是另外一篇巨nx的pnas。。。。。
从 1955-1963年，他一直在phage这个领域混，后来德尔吕布克给他写了封信，说再看benzer的paper实在无趣了。。。。。其实从 1960s开始，在中心法则基本建立之后，很多人认为分子生物学的框架基本建立，应该转向去研究发育和思维的问题。所以Brenner天天在英国转悠，后来从土里发现一种叫c.elegans的线虫，一个新的领域就开拓了。。。。。这个我们以后再表。所以Crick也跑到Salk去研究灵魂了，还写了本 “惊人的假说”。
Benzer后来被德尔吕布克挖到当时摩尔根学派的中心Caltech，到神经生物学家Roger Sperry（1966 生理奖）实验室转悠了一圈，觉得神经生物学有劲的，但是在小猫小狗小猴子做不了大尺度的东西，后来在Lewis（1995 生理奖，另一神人，延续morgan的路走了很多年）实验室见到了果蝇，于是他就转行去做果蝇研究行为了 那个年代，他和Brenner都被认为是异想天开，用线虫和果蝇研究我们的大脑。。。。。。没办法，Benzer只好利用他的美国科学院院士身份在 pnas上灌灌水。。。。。。于是传奇继续。。。。。。于是出现了一个新的词 neurogenetics......
利用他在工程物理上的专长，他设计了很多小仪器来研究果蝇的行为。先是研究果蝇的趋光性，他发现一个果蝇突变不能感受紫外线，发现是果蝇每个小眼的R7 photoreceptor没有了，命名为sevenless，后来这就是大名鼎鼎的RTK-RAS-MAPK pathway，整整让许田同学的老板Gerry Rubin在果蝇里和韩泯同学的老板Paul Sternberg在线虫里不知道在CNS上灌了多少水。。。。。也让果蝇复眼成为整个果蝇领域的一个最well studied的系统。其实sevenless是副产品。。。。
后来Benzer还发展了记录果蝇脑电，眼电的种种技术。。。。。
最重要的是，后来Benzer筛选出一大堆昼夜节律的果蝇突变体（period），短节律，长节律，无节律。。。。开创了circadian rhythme 这个领域，后来在老鼠和仓鼠的工作进一步晚上了节律行为的调节机制。。。。。当时没有人相信这个结论：基因决定行为
一个著名的段子在Benzer和德尔吕布克之间展开。在Benzer在caltech给了关于period这个基因影响节律行为的seminar后：
“I don’t believe it,” said Delbrück
“But Max,” Benzer said, “we found the gene!”
“I don’t believe a word of it,” said Max.
同时，在Benzer实验室筛出一大堆突变体：关于学习记忆的；关于长寿的；关于食欲的；关于肥胖的；关于癫痫的；关于神经发育的；关于求偶交配的；关于痛觉的；关于神经退行性疾病诸如阿氏海默的。。。。。几乎每一个领域Benzer实验室都培养了nas或者hhmi大牛。。。。
终于也没有人质疑他的观点，今天的神经生物学很大程度上还是按着Benzer的方式在发展。。。。在Benzer和Brenner之后，很少再出现这种集大成者的生物学家，研究越来越细化，越来越像industry，不知道是好事还是坏事了。而Caltech的摩尔根学派神话时代也宣告结束，西海岸的生物研究重心开始北移，然后ucsf的黄金时代开始了。。。。。。。。。
Benzer是著名的夜猫子，然后对古怪食物有着狂热的爱好，在Benzer逝世后，Larry带着他实验室全体成员到Pasadena一家Benzer经常去的餐馆点了Benzer最喜欢的生蜗牛，一种不知名的非洲甲壳虫。。。。。拍照留念。。。。。
R.I.P.
Benzer once said: "If everyone you talk to says you shouldn't do something, you probably shouldn't do it, and if everyone says you should do something, you should also probably not do it; but if half the people you talk to tell you to do it and half say you're crazy, then you should definitely go ahead."
一个时代行将落幕，但是一个新的时代开始了么？
今天11月30号，俺个衰人有无数的construct要做，有两个deadline要赶，还有TA的课要出卷子。。。
但是今天我还是要写写日志，写写我非常敬佩的一个生物学家，今天是他的纪念日
Seymour Benzer （1921-2007.11.30）
从某种意义上讲benzer是Watson，Crick，Jacob，Monod，德尔吕布克那一辈开创生物分子生物学的黄金一代硕果仅存的几位：Crick逝世，Watson基本在忽悠，俺们线虫的老祖宗Brenner现在基本已经没有人懂他在说什么。。。。
他的逝世代表了一个时代开始终结，不知道是不是另一个时代的开始？。。。。
他没有能得到Nobel奖，但是他在半导体物理，分子生物学，神经生物学都有巨大贡献，是当之无愧的无冕之王，侠之大者。
在他逝世后，他的学生在Nature，Science，Neuron，Plos Bio，Genetics，Cur Bio上发表文章悼念他
他在逝世之后的三年，还有Cell，Neuron，Cur Bio，PNAS陆续发表，虽然通讯作者已经是他的学生或者同事，斯人已逝，余香袅袅。
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最早知道Benzer还是在本科学生化和遗传的时候，教科书上提到过的利用噬菌体（phage）遗传学解决了基因的精细结构问题，虽然当年北大王镜言版的生化就从来没有把这个问题讲清楚过，当然当年乔爷也只是泛泛的提到而已。。。。。。没想到到了美国学遗传课，才有机会重新读了读他那篇里程碑的1955年的 PNAS，更没想到哥么ribonsome在jhu选了门Jeremy Nathan开得的文献选读课，第一篇就是这篇pnas，这是后话 暂且不表。
后来在科学院上bio2000，听了ucla 大美女Ming Guo的讲座才知道她的phd老板，大名鼎鼎的詹裕农，叶公杼夫妇的导师是Benzer，她的postdoc老板 Larry Zipursky的导师也是Benzer，她讲Benzer他老人家80岁高龄还在实验室数果蝇，她还推荐了一本关于Benzer的传记
Time, Love, Memory: A Great Biologist and His Quest for the Origins of Behavior
作者是普利策奖得主
再后来，听了詹裕农，叶公杼夫妇的一堆弟子的talk，Morgan Shen，骆利群，利民，钟为民，对Jan夫妇敬佩的同时时不时会想想他们的老板 Benzer；后来和ribonsome闲聊的日子里，听他讲DSCaM，听他讲去Larry Zipursky实验室的见闻，对Larry同学惊为天人。。。。
再后来，到了美国，因为要去果蝇（fruit fly）实验室做rotation，在恶补果蝇知识的时候读了本 fly push，它的作者Greenspan也是Benzer的博后；后来在一位出身caltech Sternberg 实验室，Larry的postdoc，灰常聪明的老师手下做第三轮rotation，Benzer是他的phd thesis committee，听他聊benzer的趣事。据说这哥么仅靠一篇半neuron横扫北美tier 1学校的offer，相当大的一部分原因是他有Benzer的推荐信，当然他骇人听闻的smart也是重要原因。。。。。
再后来，告别果蝇，加入了现在的线虫实验室，实验室新来的博后师姐来自Upenn，她的导师 Nancy Bonini也是Benzer的博后，也是Benzer的粉丝。。。。后来干脆买了本Time, Love, Memory: A Great Biologist and His Quest for the Origins of Behavior，细细读来，真得是生物学的传奇啊！
就容小的来给各位看官侃侃吧
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Benzer，波兰裔犹太人，出生纽约，二战期间在当时工程物理大牛校 Purdue读phd，为曼哈顿计划服务，发展高功率雷达。因为当时受体积巨大，能耗惊人的电子管束缚，雷达始终面临瓶颈。Benzer的phd project就是发展可能的电子管替代半导体，他发明的锗掺杂技术，证明可以实现高压下整流效果，然后顺利毕业。。。。。如果故事到了这里就结束，那就不是传奇了。
他发明的这项技术专利一年后来被Bell实验室的仨人：巴丁，肖克莱，布拉克利用，发明了晶体管。。。。。Benzer后来还应邀参加了这三人的庆祝诺贝尔奖的party。。。。
靠着这本事，Benzer顺利在Purdue物理系拿到tenure track，结果他不误正业，在读了薛定谔的“生命是什么”（what is life？）之后被忽悠，开始搞biophysics，从purdue请假到处做postdoc，满世界的整整逛了4年，差点被purdue开了。 期间遇到phage的一代教父Max Delbruck （德尔吕布克，玻尔的学生）
，觉得这种细菌病毒不错，回到purdue开始转型做噬菌体。。。。。 他做了啥捏？
当时经典遗传学从孟德尔到摩尔根，从豌豆数到果蝇，基本确定基因是在染色体上线形排列的；根据Watson和Crick的DNA 双螺旋结构工作，遗传物质是核酸，是DNA。但是基因和核酸之间到底是什么关系，并不清楚。这个工作的主要构架就是Benzer完成的。他用筛到的数量巨大的T4 phage的rII（rapid lysis）突变体之间做杂交。根据经典遗传学互补测试（complementation test）概念，同一个基因的两个突变体（allelles）杂交，得到的还是突变体。但是在Benzer的系统中，因为样本巨大（一个大肠杆菌可以产出上千个phage）他发现可以得到少量的正常phage，可以正常侵染大肠杆菌。他推测这是源于两个突变DNA重组后得到正常个体的结果。这表明基因不是最小的遗传分子单位，揭示了基因可以有更精细的结构。。。。。。结果发表在当年的nx杂志PNAS上，成为分子生物学的里程碑之一。
后来他的rII被Crick和Brenner利用，利用rII在核酸水平上的精度证明了三联密码子假说，当然这又是另外一篇巨nx的pnas。。。。。
从 1955-1963年，他一直在phage这个领域混，后来德尔吕布克给他写了封信，说再看benzer的paper实在无趣了。。。。。其实从 1960s开始，在中心法则基本建立之后，很多人认为分子生物学的框架基本建立，应该转向去研究发育和思维的问题。所以Brenner天天在英国转悠，后来从土里发现一种叫c.elegans的线虫，一个新的领域就开拓了。。。。。这个我们以后再表。所以Crick也跑到Salk去研究灵魂了，还写了本 “惊人的假说”。
Benzer后来被德尔吕布克挖到当时摩尔根学派的中心Caltech，到神经生物学家Roger Sperry（1966 生理奖）实验室转悠了一圈，觉得神经生物学有劲的，但是在小猫小狗小猴子做不了大尺度的东西，后来在Lewis（1995 生理奖，另一神人，延续morgan的路走了很多年）实验室见到了果蝇，于是他就转行去做果蝇研究行为了 那个年代，他和Brenner都被认为是异想天开，用线虫和果蝇研究我们的大脑。。。。。。没办法，Benzer只好利用他的美国科学院院士身份在 pnas上灌灌水。。。。。。于是传奇继续。。。。。。于是出现了一个新的词 neurogenetics......
利用他在工程物理上的专长，他设计了很多小仪器来研究果蝇的行为。先是研究果蝇的趋光性，他发现一个果蝇突变不能感受紫外线，发现是果蝇每个小眼的R7 photoreceptor没有了，命名为sevenless，后来这就是大名鼎鼎的RTK-RAS-MAPK pathway，整整让许田同学的老板Gerry Rubin在果蝇里和韩泯同学的老板Paul Sternberg在线虫里不知道在CNS上灌了多少水。。。。。也让果蝇复眼成为整个果蝇领域的一个最well studied的系统。其实sevenless是副产品。。。。
后来Benzer还发展了记录果蝇脑电，眼电的种种技术。。。。。
最重要的是，后来Benzer筛选出一大堆昼夜节律的果蝇突变体（period），短节律，长节律，无节律。。。。开创了circadian rhythme 这个领域，后来在老鼠和仓鼠的工作进一步晚上了节律行为的调节机制。。。。。当时没有人相信这个结论：基因决定行为
一个著名的段子在Benzer和德尔吕布克之间展开。在Benzer在caltech给了关于period这个基因影响节律行为的seminar后：
“I don’t believe it,” said Delbrück
“But Max,” Benzer said, “we found the gene!”
“I don’t believe a word of it,” said Max.
同时，在Benzer实验室筛出一大堆突变体：关于学习记忆的；关于长寿的；关于食欲的；关于肥胖的；关于癫痫的；关于神经发育的；关于求偶交配的；关于痛觉的；关于神经退行性疾病诸如阿氏海默的。。。。。几乎每一个领域Benzer实验室都培养了nas或者hhmi大牛。。。。
终于也没有人质疑他的观点，今天的神经生物学很大程度上还是按着Benzer的方式在发展。。。。在Benzer和Brenner之后，很少再出现这种集大成者的生物学家，研究越来越细化，越来越像industry，不知道是好事还是坏事了。而Caltech的摩尔根学派神话时代也宣告结束，西海岸的生物研究重心开始北移，然后ucsf的黄金时代开始了。。。。。。。。。
Benzer是著名的夜猫子，然后对古怪食物有着狂热的爱好，在Benzer逝世后，Larry带着他实验室全体成员到Pasadena一家Benzer经常去的餐馆点了Benzer最喜欢的生蜗牛，一种不知名的非洲甲壳虫。。。。。拍照留念。。。。。
R.I.P.
Benzer once said: "If everyone you talk to says you shouldn't do something, you probably shouldn't do it, and if everyone says you should do something, you should also probably not do it; but if half the people you talk to tell you to do it and half say you're crazy, then you should definitely go ahead."
一个时代行将落幕，但是一个新的时代开始了么？
有关键情节透露
