生物大分子的X射线晶体学 评价人数不足
读书笔记 第13章 结构精修
来回晃悠

此处主要重点阐述了R因子和自由R因子的概念,对于初学者来说比较重要。

第一个标准是结晶学中的R因子,它被定义为结构振幅的实测值(Fobs)与结构振幅的计算值(Fcalc)之间的残差。
一般来说,用同晶置换(MIR)或其他电子密度图构建出来都大分子模型初始的R因子大约为40%-50%,而经过适当修饰后的R因子通常为20%左右。R因子的应用是计算自由R因子(R-free)。在此法中,大约10%的衍射数据不用于结构精修,而R-free就是根据这些衍射数据计算的。很显然,自由R因子比R因子会大一些,但应该比较接近。自由R因子与R因子的差值一般在2%-5%的范围内,如果差别大于10%,说明结构是可疑的。根据经验,一个正确的结构,其自由R因子约为分辨率数值的10%。例如,分辨率为2.5埃时,自由R因子应约为25%。小的R因子(≤20%)是结构正确性的重要指标,但并不是绝对的,有些部分错误的结构也能得到小于20%的R因子。
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